مرتضی نجفی فعالیت خود را درسال ۱۳۷۹ با سریال خواب و بیدار دستیار فیلمبردار مرحوم رسول احدی و به کارگردانی مهدی فخیم زاده آغاز کرد. مرتضی نجفی که کار خود را با دستیاری و کسب تجربه در کنار دانش و علم این حرفه آغاز کرده بود، برای فیلم تومان برندهٔ سیمرغ بلورین بهترین فیلمبرداری از سی و هشتمین جشنواره فیلم فجر شد. او در سال بعد نیز، برای دو فیلم روشن و یدو نیز برنده سیمرغ بلورین بهترین فیلمبرداری در سی و نهمین جشنواره فیلم فجر گردید.